Добрый день!
Если 6-ти летний ребенок гражданин Украины, то на него распространяются те же правила, что и на взрослых граждан Украины - подача документов в консульство или посольство Чехии на получение визы свыше 90 дней (в том числе и по воссоединению семьи) может быть только на территории Украины.