Вообще вопросов много, но начну с главного, если эта ситуация решаема, то задам все остальные вопросы.
Ситуация такая. Муж работает программистом на одну Калифорнийскую компанию удаленно, по контракту, мы здесь платим налоги. Вопрос такой, можно ли эту его работу зарегистрировать как юр.фирму. Оформить счет, ему туда будет приходить з/п дважды в месяц, это будет считаться, что фирма - не пустышка, а реально работает? Смущает то, что услуги будут оказываться не чехам, а некоему американскому дяде. Смутит ли это чехов или им все равно кому что оказывается - главное оплата налогов? Поскольку собираемся покупать квартиру, юр.адрес на нее бы и оформили. Мужу для работы нужен только стол и нормальный Интернет.

Добрый день!
Постараюсь по порядку ответить на Ваши вопросы:
Вопрос такой, можно ли эту его работу зарегистрировать как юр.фирму. Оформить счет, ему туда будет приходить з/п дважды в месяц, это будет считаться, что фирма - не пустышка, а реально работает?
Можно. Только нужно учесть, что будет необходимо поменять контракт, который должен быть заключен между юридическими лицами, т.е. Вашей чешской
фирмой и Калифорнийской компанией.
Смутит ли это чехов или им все равно кому что оказывается - главное оплата налогов?
Чехов вообще ничего не смущает, это очень лояльная нация. Чешскому государству, а конкретнее, соответствующим контролирующим оганам, важно, чтобы юридическое лицо платило налоги.
Поскольку собираемся покупать квартиру, юр.адрес на нее бы и оформили.
Наличие собственной недвижимости, снимает массу вопросов, у Вас нет необходимости платить деньги за "чужой адрес", Вы сами получаете почтовую корреспонденцию. Ну и пожалуй самый сложный сейчас для иностранцев вопрос, наличие чешской прописки для регистрации, при наличии своей недвижимости, Вы избегаете необходимости, обращаться за пропиской к другим людям, контролировать метры, надписей на почтовом ящике и пр.