когда я приеду в чехию после открытия фирмы, смогу ли я получить ВНЖ если буду арендовать квартиру, и смогу ли я выехать в германию в гости.

получить долгосрочную визу и в последствие ВНЖ Вы сможете на основании участия в юридическом лице. Аренда квартиры здесь роли не играет. В Германию Вы сможете выехать на второй год, когда Вы продлите первую визу ( на территории чехии). Вторая виза будет шенгенской и Вы сможете передвигаться свободно по территории Шенгена.