На этом основании, Вам уже сделанную визу вряд-ли закроют, но при последующем продлении документов могут спросить договор и если его у вас не будет, то Вы можете понести административное наказание, какое оно будет решать полиции.

а если мы подпишем новый договор (со своими знакомыми), которые живут в маленькой 2-х комнатной квартирке с детьми, и соответственно там жить не будем, потому что мы в Отъезде.
Все это происходит не в Праге, здесь полиция тут же при регистрации побежала проверять наше наличие по адресу. Отъезд за границу - Это веское основание для нашего более чем полугодового отсутствия?

Вероятнее всего,что визу вам не порушат.Но в обязательном порядке вы должны будете иметь этот договор при следующем продлении визы.Его отсутствие будет являться основанием для отказа в продлении визы.

т.е полиция будет в курсе, что договор не был продлен, но при продлении визы ее устроит договор, сделанный задним числом?

Сейчас, когда вы продляли визу,полиция для себя сделала отметку в ваших документах о недостающем договоре.Следующее продление начнется именно с решения этого вопроса.Как посмотрят полиция на то,что договор подписан задним числом неизвестно.Мы всегда своим клиентам советуем не нарушать законодательства Чешской Республики и не создавать себе проблемы связанные с этим.